前情提要：Falcone与Maroni的黑帮战争发展到高潮，最终Gordon背叛了企鹅，Falcone离开了哥谭市，而企鹅杀死了刚刚回归的Fish Mooney，宣布自己成为新的哥谭之王。在Alfred的帮助下，Bruce Wayne发现了一条通向父亲的私人办公室（一个洞穴）的秘密通道。Barbara杀死了父母并攻击Leslie，导致她被关进阿卡姆疯人院。日后的「谜语人」Nygma也第一次尝到杀人的滋味。

在2×01《Rise of the Villains: Damned If You Do,…》中，企鹅成了哥谭之王。哥谭市警署发生一系列巨变之后，James Gordon侦探被降了职，他的道德观也发生波动，他开始寻求企鹅的帮助。与此同时，Bruce Wayne继续探索父亲的办公室里的秘密。新来的坏蛋Theo Galavan（James Frain）和他的妹妹Tabitha（Jessica Lucas）结交了一些不靠谱的盟友——被关押在阿卡姆疯人院里的一群危险的疯子。

接下来会发生什么

第二季被定义为「坏人的崛起」，因此这一季更紧张刺激、场面更宏大、更有「史诗」味道。坏人实在太多、太厉害，以至于哥谭市急需蝙蝠侠这样的超级英雄来拯救。与此同时，别指望企鹅能在王位上坐太长时间，觊觎王位的势力全都不好对付。就以亿万富豪Theo Galavan和他的妹妹Tabitha（人送外号「飞虎女」）来说，他们表面上声称自己是哥谭市的拯救者，背地里却在推行一个彻底毁灭这座城市的超级阴谋。他们释放了阿卡姆疯人院里最危险的囚犯，组织了一个名叫「狂人帮」（Maniax）的邪恶团伙。毫无疑问，Jerome将成为「狂人帮」的领袖。

在哥谭市警署内部，Harvey已经离职，Gordon从侦探降为普通警察（交通警察？），新警监Nathaniel Barnes（Michael Chiklis）走马上任。Barnes看起来像是个好警察，他打算接手Jim发动的「拯救哥谭市警署」运动，但他的真实目的并不十分明确。

Bruce在父亲的办公室里发现的秘密导致他和Alfred发生矛盾，他将深入一个更真实、更黑暗、更成人化的世界。无论如何，Alfred最终都会训练Bruce，蝙蝠侠由此诞生。寻找父母遇害的真相、揭开父亲办公室里的秘密和处理「刚刚萌芽的新爱情」是Bruce本季的三大任务。这里所说的「新爱情」并不是指Selena，而是美丽迷人的少女Silver St. Cloud（Natalie Alyn Lind）。Bruce和Selena重逢之后，他们的关系将停留在以前的水平上（尽管Selena已经开始向黑暗面堕落）。但是随后会发生一些事情，导致Selena不再与Bruce接触，这才是他们的关系真正恶化的开始。或许正因为感情跌入低谷，Bruce才会轻易拜倒在Silver St. Cloud的石榴裙下。

为了打赢一场正义的战争，James Gordon可能不得不拥抱黑暗——永远都做正人君子将让他寸步难行。Morena Baccarin本季被提升为常规演员，她扮演的Leslie将继续留在Gordon身边。与此同时，Gordon的前未婚妻Barbara正式成为阿卡姆疯人院团伙中的一名成员。看起来，编剧组有意让Barbara和Jerome（或许是未来的「小丑」）亲近……但是Barbara不会轻易放过Gordon，她从第二季首集开始就一直纠缠他。当Leslie发现Barbara从阿卡姆疯人院给Gordon打电话时，她显然有点不高兴。在2×03中，Leslie会有一个迷人的新追求者。

值得一提的是，本季之所以被称作「坏人的崛起」，是因为新增的坏人的确不少——「泥面人」、「急冻人」、「火烈鸟」、「萤火虫」、「飞虎女」……甚至Silver St. Cloud也有严重的黑暗倾向。

在第二季开始后不久，会有两名重要角色先后丧命。其中一人之死非常突然，非常出人意料；另一人之死则会强烈震撼Gordon，成为他本季的「故事推动力」。死的应该不是Leslie，否则将Morena Baccarin提升为常规演员就没任何意义了……但这实在很难说。