在《史前新纪元》季终集里，Lucas率领凤凰组织的雇佣军攻占了新纪元殖民地，Shannon一家人及一千多名殖民地居民沦为俘虏。与此同时，Taylor带领几十名殖民地守备军藏身在密林之中，等候时机与Jim Shannon等人里应外合，夺回家园。

2149年，Lucas和一个叫Weaver的「商人」正计划派遣凤凰组织的雇佣军前往新纪元殖民地进行掠夺。而在8500万年前的史前时代，Taylor和Jim正调派新纪元殖民地三分之二的守备军控制传送门及其周边地区。Josh想去传送门等候Kara，被Jim拒绝。但Jim称他会照顾好Kara。第11批朝圣团如约抵达，Kara也在其中。一开始一切都很顺利，直到一个「人体炸弹」出现……嘣！刚露脸还不到一分钟的Kara死了，Jim被震晕了……Taylor和Jim做了那么多准备，最终一切付诸东流。

三天后，Jim在殖民地医院醒来。他的听力还没有完全恢复，而眼前的一切让他感觉震惊：殖民地里到处是断壁残垣，凤凰组织的坦克和士兵正在大街上训练。他想去司令部寻找Taylor，但遭到士兵的驱赶。Elizabeth把Jim接回家，解释了最近这几天发生的事情。她还称Taylor并没有被俘，这对Jim来说多少是个安慰。

Jim安慰了Josh几句（毫无疑问，Josh长期以来的努力全白费了），然后去找被迫向敌人缴械投降的Washington。Washington被「关押」在Boylin的酒吧里－－这是一种「不是监狱胜似监狱」的做法，面对如此众多的凤凰组织士兵，她无论如何都是不敢乱来的。不过让人费解的是，凤凰组织竟然允许一个囚犯和外人「密谈」？Washington告诉Jim，凤凰组织带来了一个双向传送门，但被恐龙弄坏了（真凑巧），他们需要修复它。为了让Malcolm乖乖就范，凤凰组织杀死了Malcolm的实验室助手。Jim于是又在「无人盯防」的状态下大摇大摆地走进Malcolm的实验室，要Malcolm尽力拖延时间。Mira和Lucas打断了两人的对话，逼Jim说出Taylor的下落。Jim在Malcolm的帮助下装聋作哑扮瘸子，竟然蒙混过关了！

第二天，Weaver带来了凤凰组织神秘领袖的新指示：Mira必须尽快带一组人去探索「不毛之地」。与此同时，Lucas和Skye进行了一番「亲昵交谈」，Lucas甚至称呼Skye为「妹妹」。在看过《双面法医》（Dexter）第六季大结局后，这种「兄妹表白」的场景我们已经可以「免疫」了……Jim安排Josh回到Boylin的酒吧打工，伺机打探凤凰组织的消息。Elizabeth从受伤士兵的体内取出数颗子弹，但很快发现每颗子弹上都有手写的数字。「聪明」的Jim立刻判断出这是Taylor发送的接头地点的坐标。这是……《神雕侠侣》？「我在绝情谷底」？

Lucas和Weaver前往一处山谷查看地形。他们计划用一颗威力无比的炸弹将那里夷为平地，然后毫无顾忌地采掘价值不菲的矿产资源。真的？这部剧集的「终极剧情」就是为了争夺矿产资源？无论如何，先不要想这个愚蠢的问题－－如果该剧没有第二季，这个问题就永远不会有答案了。Jim在其他人的帮助下混在Lucas的车队中溜出了殖民地，与Taylor接上了头。Taylor计划夺回殖民地，但他们的首要任务是阻止Lucas和Weaver释放炸弹。再一次很凑巧的是，Taylor身边跟着一位「拆弹专家」，三下五除二就把一颗复杂的炸弹给解决了。气急败坏的Lucas捧起「超级火箭筒」对山谷里的树林一顿猛轰，但Taylor等人最终还是逃脱了。

Jim和Taylor商量好下一步打算后，赶在凤凰组织起疑心之前返回了殖民地。与Elizabeth一夜缠绵之后，第二天一大早，Jim心情舒畅地与Washington开始了间谍活动。他们在每一辆外出巡逻的凤凰组织车辆上安装跟踪装置，Taylor则率领手下逐个伏击巡逻队。在这个节骨眼上，Lucas还一心想着与Skye套近乎，招致Josh的痛殴。Lucas命人抓住Josh，把他打了个半死。Skye找来Jim，Jim又把Lucas和他的手下打了一顿。双拳难敌四手，Jim最终被凤凰组织的士兵俘虏。Lucas在Jim身上搜出无线电通讯装置后，将他和Josh一起关进了监狱。

Skye把Josh救了出去，但Jim就没那么幸运了。还好Lucas的盟友Weaver是个草包，被Elizabeth忽悠一番之后，心甘情愿地把Jim带离了监狱。Elizabeth制服Weaver之后，带着Jim、Josh、Maddie和Zoe逃离了家。Lucas扑了个空，立刻展开地毯式搜索。此时Taylor已经带人来到殖民地外准备接应Jim一家人，但他们根本不可能顺利跑到殖民地边界而不被发现，Washington决定留下来分散敌人的注意力。Taylor一家人脱险后，Washington却被Lucas抓住。冷血的Lucas一枪打死了Washington，Taylor只能眼睁睁看着这一切发生。

回到营地后，Taylor的心情非常差，小Zoe给了他些许安慰。Jim将Washington临终前的话转达给Taylor，Taylor立刻顿悟：我们应该炸掉凤凰组织的双向传送门。不，不仅仅如此，连希望中心也要一起端掉！这样2149年和新纪元殖民地就永远失去联系了。尽管知道这样做会让他们重返「原始社会」（药品、高科技设备、武器弹药和其他补给品都没了），但他们还是决定这样做。

Weaver告诉他的主子，他们在「不毛之地」发现了某些东西，一些非常令人感兴趣的东西。Lucas准备将他们发现的东西通过传送门运回2149年，Skye跳上了他的车，Lucas并没有多想。Skye在途中称自己能够帮助Lucas找到Taylor，复仇心切的Lucas立刻停车。于是，他遭到Taylor手下人的伏击，车上的货物也被掉包了。Jim钻进货箱，两名假扮凤凰组织士兵的殖民地守备军将货箱连同Jim一起送到了传送门。

Skye留下来看管Lucas，但Lucas挣脱束缚，打晕了Skye。Skye「及时」醒过来通知了Taylor，Taylor在半路上拦下Lucas，将其痛揍一顿。Lucas痛哭流涕，称自己已经悔悟……但他暗中掏出一把匕首狠狠捅了老爸一刀！Skye「及时」赶到，连开两枪放倒Lucas，救了Taylor一命。你瞧，Skye总是能在最需要的时候出现，但……她的枪法真的很糟糕－－中了两枪的Lucas竟然逃走了！

Jim和那个被掉包的「货物」顺利返回了2149年，Weaver洋洋得意地当着主子们的面打开了货物……竟然是一头霸王龙！Jim给霸王龙打了一针激素，霸王龙见人就咬，在场的所有人（除Jim外）都被吃掉或咬死了。Jim乘乱引爆了炸弹，并在传送门毁掉之前逃回了史前时代。

残留在史前时代的凤凰组织士兵和Mira率领的「第六团」成员在得知传送门毁灭的消息后立刻离开新纪元殖民地前往「不毛之地」，Taylor、Jim和流浪在外的殖民地守备军「回家」庆祝胜利。

凤凰组织在「不毛之地」发现了一艘船的残骸，而这艘船竟然来自19世纪！

在本剧第一集中，Shannon一家人坐在门口看月亮；而在本剧最后一集中，Shannon一家人坐在门口看流星－－这也算是首尾呼应吧。

你对第一季有何看法？你希望看到第二季吗？